Много мутаций, но мало данных: что известно о новом штамме коронавируса Омикрон

Новый вариант Омикрон / Sky News

Новый штамм коронавируса Омикрон, который обнаружили в Южной Африке, имеет много мутаций и вызвал новую волну мирового беспокойства.

Впрочем, пока нет точных данных, вызывает ли он более серьезное течение, чем уже известные варианты, и избегает ли иммунной защиты.

Мутации сверх нормы

Омикрон имеет больше 50 выявленных мутаций , 32 из них – на поверхности белка, который находится на шипе коронавируса (так он подсоединяется к рецептору ACE2 и входит в тело человека – 24 канал).

Есть информация, что этот невероятный конструктор собрался в организме человека, больного ВИЧ-СПИДом, который к тому же имел «долгий ковид». СПИД является очень распространенным на юге Африки. У таких больных вирус живет долго и может собирать мутации в таком темпе, на который вирусная эволюция в обычном случае не способна.

Омикрон имеет мутации не только в спайк-белке, но и в протеине самого ядра вируса (нуклеокапсидный белок – 24 канал). Это R203K и G204R, которые могут сделать вирус более заразным. Далее три изменения в шипе позволяют проникать в клетки человека легче. Пропущенный белок в мембране может помочь вирусу распространиться.

Инфографика о новых мутациях у варианта Омикрон / Коллаж Daily Mail

Их очень много, но это тоже большой изъян, потому что вместе они могут и не сработаться . Большинство изменений, отмечают в NYT, вредят больше самому вирусу, чем окружению или носителям. Впрочем, некоторые из них предоставляют отдельному штамму преимущества перед другими.

Обычно они могут работать друг против друга. Но в этом конкретном случае эволюция скорее поставит на благоприятные условия для распространения,
– сказал эволюционный биолог Фред Хатчинсон из Центра исследования рака в Сиэтле.

«Штамм Омикрона, описанный недавно, имеет мутации, которые ранее видели в Дельте (помогают распространиться), а также в Бете (иммунный побег). Комбинация представляет собой потенциально значительный риск на фоне снижения натурального и вакцинального иммунитета», – отреагировали в компании Moderna, передает CNN.

У Омикрона есть мутации, которые уже замечали в Дельте / Фото Pixabay

В компании также предупредили, что «существующие вакцины могут быть менее эффективными против (распространения) нового варианта», пишет Euronews.

В Европе (Нидерланды, Германия) уже есть случаи, когда люди заразились, хотя никуда не путешествовали.

Немного контекста:

  • Возможное преимущество в распространении означает, что этот вариант быстрее передается большему количеству людей. В том числе в среде защищенных вакциной или антителами против болезни;
  • Иммунный побег означает, что может увеличиться количество инфекций после вакцинации – так называемых прорывных инфекций. Это укажет на некоторое снижение эффективности прививок;

Это не означает, что Омикрон абсолютно точно может вызвать более тяжелое течение болезни, легче распространяться или лучше избегать иммунной защиты человека. Но много мутации вместе, которые ранее встречались в нескольких вариантах по отдельности, настораживают.

Откуда взялся Омикрон

Впервые вирус заметили в Ботсване в ноябре, В.1.1.529 попал в Южную Африку, а оттуда – в Гонконг. Сейчас его уже фиксируют в странах Европы. В какой стране он появился, до сих пор остается загадкой.

Сейчас ученые из Южной Африки, США и всего мира работают чуть ли не круглосуточно, чтобы понять качества и опасность нового штамма , пишет издание Scientific American.

Пока что у научного сообщества один и тот же ответ: «Мы почти ничего не знаем, собираем данные». Сейчас делают искусственную модель Омикрона со всеми выявленными изменениями и тестируют на ней действие вакцин.

Это урок, выученный в 2020 году, когда из ЮАР вышел первый «вариант беспокойства» – Бета. Тогда много внимания было уделено мутации E484K, но у Беты были еще две , которые помогают избегать антител после вакцинации.

Южная Африка нашла на своей территории уже два варианта ковида / Middle East Online

Три из них дали большее сопротивление, чем сама E484K. Изучение только ее было неверным путем,
– объяснила NYT вирусолог из Национального института инфекционных болезней Южной Африки Пенни Мур.

Омикрон против Дельты

Омикрон, как сообщила лаборатория биоинформатики Тулио де Оливейры в Университете Квазулу-Натал, ответственный за все 77 взятых образцов в провинции Гаутенг (где расположена одна из столиц – Йоханнесбург). Вероятно, их еще больше.

«Есть вероятность, что он уже распространился по всей стране и за ее пределы», – признал Ричард Лессельс, врач-инфеционист в Дурбане, ЮАР. Омикрон – только дальний родственник Альфы и Дельты, но не происходит прямо от них.

Появление Омикрона подчеркивает неравенство вакцинации в мире . Тогда как Старый и Новый миры и богатые страны Азии и Ближнего Востока уже вакцинируют население третьей дозой (т.н. «бустером» – 24 канал), Африка и бедные государства не всегда могут начать прививку даже первой . Это дает вирусу отличную площадку для дальнейших экспериментов и мутаций.

По крайней мере в Южной Африке, B.1.1.529 замещает Дельту гораздо быстрее, чем она в свое время делала это с Бетой , говорят эпидемиологи на основе ранних данных.

Что может быть дальше

Новый вариант заметили быстро, но на точные ответы потребуется некоторое время , отметили ученые. Как пишет издание STAT News, проходили месяцы, пока ученые разбирались с предыдущими штаммами SARS-CoV-2.

На полный анализ Омикрона уйдут недели напряженной работы. Ученые теперь быстро начинают исследования, чтобы понять уровень нейтрализации антител и взаимодействия с Т-клетками,
– объяснила Шэрон Пикок, директор британского консорциума Covid-19 Genomics.

Если он сможет закрепиться в других странах мира и начнет вытеснять Дельту еще и там , то по словам ученых, можно будет говорить о более быстрой передаче Омикрона.

Ученые начнут исследования, чтобы ответить на все вопросы / Фото Today in 24 English

С побегом от иммунной защиты все еще проще: ученые могут взять антитела из крови человека и «выставить» их на бой против модели Омикрона. Это позволит посмотреть, настолько успешно они смогут противостоять всем мутациям. Впрочем, на это понадобится длительное время.

Для понимания, вызывает ли B.1.1.529 более тяжелую болезнь, медики и ученые будут смотреть на показатели госпитализаций и смертности после заражения им и сравнивать с Дельтой.

Ограничения на передвижение могут замедлить, но не остановить распространение нового варианта. Например, в нескольких странах Европы Омикрон нашли уже после объявления об ограничениях на полеты с Юга Африки. Как и в Японии, кстати.

Страны с ограниченными запасами вакцин могут попасть под удар Омикрона, если докажут его способность быстро распространяться. Между распространением и вирулентностью есть важная корреляция: если вирус быстро убивает – он не захватит новую территорию.

Что касается симптомов, то STAT News пишет, что на основе первых очень ранних данных, они могут быть легче, чем у Дельты. Но пока рано об этом говорить. Под воздействием вакцин и болезней наша иммунная система учится отражать самые серьезные последствия . Так, пандемические вирусы становятся эндемическими, то есть привычными на отдельной территории (как например грипп – 24 канал).